如何ps修改western条带的灰度值
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Western Blot是一种对蛋白进行定性的分析方法,属于常规实验操作,其数据处理是必不可少的一步。目前,发表的实验性文献中大多要求包含WB的半定量分析数据。今天,小编给大家介绍用PS进行灰度分析及之后的数据作图处理。
使用软件本文中使用的软件为Photoshop CC,其他版本的Photoshop,操作步骤基本相似。1、在PS中打开western blot2、设置参数,在图像-分析-选择数据点,选择灰度值(平均),其他选项可取消3、处理,图像-调整-反向4、灰度测量,使用魔棒工具点击要分析的条带,下面会显示出灰度值5、导出数据,点第一行后按住shift键,点最后一行进行全选数据,导出数据6、在Excel表格中计算目的蛋白和内参蛋白的平均灰度值,用平均目的蛋白除以平均内参蛋白;得到多组比值后,用GraphPad绘制柱状图(其他软件也可以)7、GraphPad绘制柱状图的过程,8、得到柱状图
wb条带 灰度数据分析需要考虑area么
1、打开电源:打开机身背部左下方机身电源开关,后打开CCD电源开关,放入凝胶、调节位置。
2、打开抽屉放入琼脂糖凝胶或SDS-PAGE凝胶或PVDF膜,打开QuantityOne软件,点击”File“选择”ChemiDocXRS“按下”Selec“键选择”WhiteEPI“按下LiveFocus按钮,勾选”Lighton“,调节凝胶位量居于视野中央。
一张WB可以多测几次灰度值吗
hotoshop中可以实现你的要求:
具体步骤如下:
1.新建一个灰度格式的文件,(象素至少不能小于要比你分析的),打开PS后,点击"文件"--"新建...",然后在"新建"对话框下的"模式"中选择"灰度",确定.
2.把你要分析的,Copy到这个灰度文件中,(待分析).这时你的电泳条带就自动变为了"灰度格式",即我们常见的"黑白模式".
3.进行灰度分析,本例我们就分析一下"月亮的灰度"吧,用魔棒工具选择月亮部分(这个就不用我多说了),
4.点击工具栏上的"图象","直方图...",然后就有了分析结果提示框了,
5.最关键的是结果分析了,结果中给出了四个参数:平均值,标准偏差,中间值,象素.我只解释一下"平均值"吧:平均值就是指你选种的区域的平均灰度为"216.9"(以0为纯黑,255为纯白为区间范围).
如果你要换算为百分制形式表示的话就是216.9/255*100%=85.1%,可以手工换算,也可以用PS的颜料盒换算,不过手工算挺方便的.
如果你的选择区域灰度比较均一的话,你的分析结果的"均值"和"中间值"应该比较接近的.以及那个"直方图""标准偏差"都是数理统计上的概念,在此不罗嗦了.
可以。WB是研究蛋白表达的一个经典方法。方法。
1、打开ImageJ软件,导入WB条带:File-Open-找到WB条带。
2、把转化成灰度,一般灰度分析的要求8bit就好:Image-Type-8-bit。
3、消除背景影响:Process>SubtractBackground.。选择50基本可以。
4、设置定量参数量Analyze>SetMeasurements,点击面积area,平均密度meangrayvalue,和灰度值IntegratedDensity。
5、设置定量单位Analyze>SetScale,在Unitoflength”边的方框里输入"pixels"像素。
6、当测定完所有条带,选结果中的Edit的“SelectAll,然后复制数据IntDen到Excel表即可进行分析。也可以直接在Results对话框中,选择File-Saveas,直接导出excel表格。在excel表格中将目的蛋白的灰度值除以内参蛋白的灰度值,进行归一化处理。以上就是一张WB测几次灰度值的方法。
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